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全基因组测序

发表时间: 2025-01-09 11:44:45

作者: 威尼斯wns888入口welcome

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肿瘤样本全基因组测序(推荐50乘深度)

肿瘤样本全基因组测序(推荐50乘深度)

文库类型:  ~ 350bp 插入片段

测序策略:  Illumina PE150 测序

测序深度: 150G raw data

基本分析内容:

1. 数据质控:去除接头污染和低质量数据

2. 与参考序列进行比对、统计测序深度及覆盖度

3. Somatic SNV/InDel/SV/CNV 检测、注释及统计(成对样本)

A+ 分析 

基本信息分析 基础上增加 5 项分析:

1. 易感基因筛查

2. 高频突变基因统计及通路富集分析

3. NMF 突变特征及突变频谱分析

4. NovoDriver 已知驱动基因筛选

5. 基因组变异 Circos 图展示


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